Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK91

Mlh1, DNA mismatch repair protein Mlh1, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlh1Q9JK91 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlh1Q9JK91 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms