Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms