Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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