Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SelenofQ9ERR7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms