Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms