Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms