Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms