Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf6Q9DBU5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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