Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrn2Q9DBR1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrn2Q9DBR1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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