Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms