Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms