Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D8N1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms