Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ifi35Q9D8C4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ifi35Q9D8C4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ifi35Q9D8C4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ifi35Q9D8C4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ifi35Q9D8C4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ifi35Q9D8C4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifi35Q9D8C4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ifi35Q9D8C4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms