Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms