Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmigd1Q9D7L8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmigd1Q9D7L8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms