Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Borcs6Q9D6W8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Borcs6Q9D6W8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs6Q9D6W8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms