Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms