Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms