Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms