Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ribc2Q9D4Q1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms