Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms