Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spns3Q9D232 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms