Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Necap2Q9D1J1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms