Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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