Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Snx7Q9CY18 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx7Q9CY18 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx7Q9CY18 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx7Q9CY18 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx7Q9CY18 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Snx7Q9CY18 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Snx7Q9CY18 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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