Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms