Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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