Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufaf1Q9CWX2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms