Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms