Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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