Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms