Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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