Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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