Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms