Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms