Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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