Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NenfQ9CQ45 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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NenfQ9CQ45 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NenfQ9CQ45 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms