Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms