Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms