Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms