Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Krcc1Q99JT5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Krcc1Q99JT5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Krcc1Q99JT5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krcc1Q99JT5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Krcc1Q99JT5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krcc1Q99JT5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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