Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms