Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms