Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms