Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clip1Q922J3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clip1Q922J3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms