Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms