Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3bQ91ZU9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms