Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Col26a1Q91VF6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Col26a1Q91VF6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col26a1Q91VF6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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