Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Slc6a20aQ8VDB9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Slc6a20aQ8VDB9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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