Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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